Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Trak1Q6PD31 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trak1Q6PD31 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trak1Q6PD31 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trak1Q6PD31 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trak1Q6PD31 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Trak1Q6PD31 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trak1Q6PD31 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trak1Q6PD31 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trak1Q6PD31 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trak1Q6PD31 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trak1Q6PD31 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trak1Q6PD31 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms