Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD19

UPF0668 protein C10orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6PD19 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Q6PD19 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q6PD19 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q6PD19 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q6PD19 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q6PD19 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q6PD19 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q6PD19 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q6PD19 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q6PD19 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q6PD19 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q6PD19 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6PD19 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6PD19 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6PD19 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6PD19 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6PD19 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6PD19 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6PD19 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6PD19 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6PD19 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6PD19 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6PD19 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6PD19 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6PD19 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6PD19 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6PD19 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6PD19 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6PD19 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6PD19 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6PD19 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6PD19 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6PD19 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6PD19 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6PD19 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6PD19 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q6PD19 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6PD19 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6PD19 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6PD19 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6PD19 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6PD19 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6PD19 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6PD19 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6PD19 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6PD19 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6PD19 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6PD19 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6PD19 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6PD19 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6PD19 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6PD19 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6PD19 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6PD19 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6PD19 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6PD19 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6PD19 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6PD19 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6PD19 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6PD19 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6PD19 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6PD19 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q6PD19 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q6PD19 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q6PD19 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q6PD19 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q6PD19 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q6PD19 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q6PD19 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q6PD19 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6PD19 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6PD19 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6PD19 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6PD19 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6PD19 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6PD19 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6PD19 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6PD19 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6PD19 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6PD19 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6PD19 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6PD19 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6PD19 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6PD19 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6PD19 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6PD19 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6PD19 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6PD19 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6PD19 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6PD19 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6PD19 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6PD19 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6PD19 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6PD19 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6PD19 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6PD19 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6PD19 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6PD19 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6PD19 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6PD19 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms