Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3E7

Hdac10, Histone deacetylase 10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac10Q6P3E7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdac10Q6P3E7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms