Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Y1

Rtl3, Retrotransposon Gag-like protein 3, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl3Q6P1Y1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rtl3Q6P1Y1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rtl3Q6P1Y1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtl3Q6P1Y1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
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Rtl3Q6P1Y1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rtl3Q6P1Y1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rtl3Q6P1Y1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtl3Q6P1Y1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtl3Q6P1Y1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtl3Q6P1Y1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rtl3Q6P1Y1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtl3Q6P1Y1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rtl3Q6P1Y1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rtl3Q6P1Y1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rtl3Q6P1Y1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtl3Q6P1Y1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtl3Q6P1Y1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rtl3Q6P1Y1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtl3Q6P1Y1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtl3Q6P1Y1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtl3Q6P1Y1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rtl3Q6P1Y1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtl3Q6P1Y1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtl3Q6P1Y1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtl3Q6P1Y1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtl3Q6P1Y1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtl3Q6P1Y1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtl3Q6P1Y1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtl3Q6P1Y1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtl3Q6P1Y1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtl3Q6P1Y1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtl3Q6P1Y1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtl3Q6P1Y1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtl3Q6P1Y1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtl3Q6P1Y1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtl3Q6P1Y1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtl3Q6P1Y1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtl3Q6P1Y1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtl3Q6P1Y1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtl3Q6P1Y1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtl3Q6P1Y1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtl3Q6P1Y1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtl3Q6P1Y1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtl3Q6P1Y1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtl3Q6P1Y1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtl3Q6P1Y1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtl3Q6P1Y1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms