Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrimpolQ6P1E7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms