Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXZ1

Krba1, Protein KRBA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krba1Q6NXZ1 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krba1Q6NXZ1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms