Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXM2

Rcbtb1, RCC1 and BTB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb1Q6NXM2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rcbtb1Q6NXM2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rcbtb1Q6NXM2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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