Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Asic1Q6NXK8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms