Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdcd11Q6NS46 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms