Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms