Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAQ7

Zzz3, ZZ-type zinc finger-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zzz3Q6KAQ7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zzz3Q6KAQ7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms