Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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