Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

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Length 675 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pram1Q6BCL1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pram1Q6BCL1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pram1Q6BCL1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pram1Q6BCL1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pram1Q6BCL1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pram1Q6BCL1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pram1Q6BCL1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pram1Q6BCL1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pram1Q6BCL1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pram1Q6BCL1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pram1Q6BCL1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pram1Q6BCL1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pram1Q6BCL1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pram1Q6BCL1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms