Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Msl2Q69ZF8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Msl2Q69ZF8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msl2Q69ZF8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms