Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Pkp4Q68FH0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Pkp4Q68FH0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Pkp4Q68FH0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Pkp4Q68FH0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Pkp4Q68FH0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Pkp4Q68FH0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Pkp4Q68FH0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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