Protein–RNA interactions for Protein: Q66X05

Nlrp4f, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4F, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4fQ66X05 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlrp4fQ66X05 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp4fQ66X05 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms