Protein–RNA interactions for Protein: Q64HY3

Sp9, Transcription factor Sp9, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp9Q64HY3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Sp9Q64HY3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Sp9Q64HY3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Sp9Q64HY3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Sp9Q64HY3 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Sp9Q64HY3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Sp9Q64HY3 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Sp9Q64HY3 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Sp9Q64HY3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Sp9Q64HY3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Sp9Q64HY3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Sp9Q64HY3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Sp9Q64HY3 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Sp9Q64HY3 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Sp9Q64HY3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp9Q64HY3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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