Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Top2bQ64511 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Top2bQ64511 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms