Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gja3Q64448 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms