Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irf4Q64287 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irf4Q64287 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms