Protein–RNA interactions for Protein: Q64124

Scx, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScxQ64124 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ScxQ64124 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ScxQ64124 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ScxQ64124 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ScxQ64124 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ScxQ64124 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms