Protein–RNA interactions for Protein: Q640M6

Gdpd5, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd5Q640M6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Gdpd5Q640M6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Gdpd5Q640M6 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Gdpd5Q640M6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Gdpd5Q640M6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Gdpd5Q640M6 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Gdpd5Q640M6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdpd5Q640M6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gdpd5Q640M6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gdpd5Q640M6 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gdpd5Q640M6 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gdpd5Q640M6 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gdpd5Q640M6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gdpd5Q640M6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gdpd5Q640M6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gdpd5Q640M6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms