Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc18Q640L5 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
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