Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms