Protein–RNA interactions for Protein: Q62458

Gm20809, (clone BALB14N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20809Q62458 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20809Q62458 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms