Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nptx1Q62443 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nptx1Q62443 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nptx1Q62443 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Nptx1Q62443 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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Nptx1Q62443 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Nptx1Q62443 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Nptx1Q62443 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Nptx1Q62443 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Nptx1Q62443 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Nptx1Q62443 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Nptx1Q62443 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Nptx1Q62443 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Nptx1Q62443 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nptx1Q62443 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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