Protein–RNA interactions for Protein: Q62231

Six1, Homeobox protein SIX1, mousemouse

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six1Q62231 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Six1Q62231 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Six1Q62231 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Six1Q62231 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Six1Q62231 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Six1Q62231 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Six1Q62231 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Six1Q62231 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Six1Q62231 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Six1Q62231 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Six1Q62231 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Six1Q62231 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Six1Q62231 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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