Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema3bQ62177 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Sema3bQ62177 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Sema3bQ62177 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3bQ62177 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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