Protein–RNA interactions for Protein: Q62148

Aldh1a2, Retinal dehydrogenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a2Q62148 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aldh1a2Q62148 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Aldh1a2Q62148 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Aldh1a2Q62148 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Aldh1a2Q62148 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Aldh1a2Q62148 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Aldh1a2Q62148 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Aldh1a2Q62148 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Aldh1a2Q62148 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Aldh1a2Q62148 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Aldh1a2Q62148 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Aldh1a2Q62148 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Aldh1a2Q62148 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Aldh1a2Q62148 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Aldh1a2Q62148 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Aldh1a2Q62148 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Aldh1a2Q62148 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Aldh1a2Q62148 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Aldh1a2Q62148 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms