Protein–RNA interactions for Protein: Q61818

Rai1, Retinoic acid-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai1Q61818 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rai1Q61818 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rai1Q61818 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rai1Q61818 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rai1Q61818 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rai1Q61818 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rai1Q61818 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rai1Q61818 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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