Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Itga6Q61739 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga6Q61739 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms