Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itga7Q61738 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga7Q61738 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms