Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcd1Q61466 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms