Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PcolceQ61398 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms