Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Foxd1Q61345 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms