Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna2Q61301 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna2Q61301 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna2Q61301 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna2Q61301 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna2Q61301 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna2Q61301 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna2Q61301 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna2Q61301 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna2Q61301 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna2Q61301 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnna2Q61301 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctnna2Q61301 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms