Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ift20Q61025 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms