Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
JrkQ60976 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
JrkQ60976 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
JrkQ60976 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
JrkQ60976 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
JrkQ60976 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
JrkQ60976 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
JrkQ60976 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JrkQ60976 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
JrkQ60976 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JrkQ60976 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JrkQ60976 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms