Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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Rbbp4Q60972 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rbbp4Q60972 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rbbp4Q60972 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rbbp4Q60972 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rbbp4Q60972 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rbbp4Q60972 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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