Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Neurod1Q60867 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Neurod1Q60867 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Neurod1Q60867 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Neurod1Q60867 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Neurod1Q60867 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Neurod1Q60867 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Neurod1Q60867 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Neurod1Q60867 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Neurod1Q60867 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Neurod1Q60867 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Neurod1Q60867 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Neurod1Q60867 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Neurod1Q60867 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Neurod1Q60867 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Neurod1Q60867 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Neurod1Q60867 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Neurod1Q60867 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Neurod1Q60867 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Neurod1Q60867 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Neurod1Q60867 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Neurod1Q60867 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Neurod1Q60867 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Neurod1Q60867 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Neurod1Q60867 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Neurod1Q60867 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Neurod1Q60867 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Neurod1Q60867 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Neurod1Q60867 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Neurod1Q60867 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Neurod1Q60867 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Neurod1Q60867 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Neurod1Q60867 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Neurod1Q60867 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Neurod1Q60867 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Neurod1Q60867 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms