Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

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Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
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Slc6a4Q60857 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Slc6a4Q60857 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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Slc6a4Q60857 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Slc6a4Q60857 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Slc6a4Q60857 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Slc6a4Q60857 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
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Slc6a4Q60857 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Slc6a4Q60857 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Slc6a4Q60857 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc6a4Q60857 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Slc6a4Q60857 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Slc6a4Q60857 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a4Q60857 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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