Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samhd1Q60710 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms