Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sin3aQ60520 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sin3aQ60520 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sin3aQ60520 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sin3aQ60520 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sin3aQ60520 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sin3aQ60520 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sin3aQ60520 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sin3aQ60520 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sin3aQ60520 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sin3aQ60520 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sin3aQ60520 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sin3aQ60520 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sin3aQ60520 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sin3aQ60520 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sin3aQ60520 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sin3aQ60520 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sin3aQ60520 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sin3aQ60520 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sin3aQ60520 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sin3aQ60520 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sin3aQ60520 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sin3aQ60520 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms