Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema5bQ60519 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema5bQ60519 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema5bQ60519 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema5bQ60519 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema5bQ60519 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sema5bQ60519 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema5bQ60519 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms