Protein–RNA interactions for Protein: Q5U5Q9

Uimc1, BRCA1-A complex subunit RAP80, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uimc1Q5U5Q9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uimc1Q5U5Q9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uimc1Q5U5Q9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uimc1Q5U5Q9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uimc1Q5U5Q9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uimc1Q5U5Q9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uimc1Q5U5Q9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uimc1Q5U5Q9 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uimc1Q5U5Q9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uimc1Q5U5Q9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uimc1Q5U5Q9 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uimc1Q5U5Q9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms