Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam71bQ5STT6 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms