Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms