Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND29

Rilp, Rab-interacting lysosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RilpQ5ND29 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RilpQ5ND29 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms