Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttf2Q5NC05 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttf2Q5NC05 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms