Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rtl5Q5DTT4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms